Pada tanggal 4 Januari 2009 terjadi gempa bumi yang menyebabkan Gedung Kantor BPK RI Perwakilan Provinsi Papua Barat di Jalan Yos Sudarso No 31 mengalami kerusakan berat sehingga sudah tidak layak untuk digunakan. Dengan alasan keamanan dan kelayakan, untuk sementara kantor perwakilan dipindahkan ke Rumah Jabatan dan Mess Pegawai BPK RI Perwakilan Provinsi Papua Barat di Jalan Sowi Gunung No 4 Manokwari sampai gedung kantor baru selesai dibangun. Untuk diketahui juga bahwa rumah jabatan dan mess pegawai tersebut merupakan bangunan baru yang pembangunananya selesai pada akhir tahun 2008.